Nantes (JOBIM 2019)

JeBiF Workshop @ JOBIM 2019 Nantes
À l’occasion de JOBIM 2019 Nantes JeBiF organise son workshop annuel.

Date et lieu

Quand ? Lundi 1er juillet 2019 14h30-18h00 et Mardi 2 juillet 2019 9h00-12h30
Où ?  LS2N, 2 chemin de la Houssinière (Tram Michelet Science)

Keynote

Morgan Magnin

Comprendre la dynamique des systèmes biologiques grâce à la modélisation hybride

L’analyse des systèmes biologiques nécessite souvent de prendre en compte les phénomènes en jeu non pas de manière statique, mais dans leur dimension dynamique (par exemple en intégrant l’impact au cours du temps du stress qu’induit un composant extérieur tel que la lumière ou l’ingestion d’une protéine). Pour ce faire, différentes approches sont possibles. Dans cet exposé, nous présenterons les mérites d’une modélisation discrète, ainsi que les challenges scientifiques associés.

Dans une modélisation hybride, l’expression de chaque composant biologique est évaluée selon plusieurs (généralement deux, mais des extensions existent) niveaux qualitatifs, et non plus quantitativement. Même si une telle discrétisation pourrait être considérée comme une abstraction moins fidèle de la réalité, elle s’est révélée, couplée à une représentation adéquate du temps, efficace dans le traitement de de nombreuses questions biologiques qualitatives (telles que la compréhension des interactions entre plusieurs composants d’un système biologique, ou la détermination de l’accessibilité d’un état).

Après avoir discuté des différents critères de modélisation à prendre en compte, nous présenterons quelques méthodes d’analyse associées à ces formalismes hybrides. Enfin, nous terminerons par des résultats plus récents, consécutifs à l’établissement de liens fructueux entre l’apprentissage automatique, la programmation logique et la bio-informatique, ce qui nous permettra de faire émerger un ensemble de nouvelles questions scientifiques.

 

Présentations flash de poster

Vous avez un poster accepté à JOBIM 2019 ? Nous vous proposons d’en faire une présentation lors de notre workshop pour nous donner envie de venir le voir.

La soumission pour les présentations flash se fait en même temps que l’inscription au workshop (voir ci-dessous).

Programme

Lundi 1er juillet

À partir de 14h : Accueil
14h30 : Introduction
14h40 : Keynote de Morgan Magnin
15h40 : Pause
16h10 : Présentation flash de posters
16h40 : Présentation de JeBiF + Ice-breaking

À partir de 19h : Social event

Mardi 2 juillet

À partir de 9h : Accueil
9h30 : Table ronde
Vers 10h15 : Pause
12h : Départ groupés pour JOBIM

Ce programme est donné à titre indicatif et est susceptible de changer.

Social Event

Le social event aura lieu à l’Atomic’s Café, 6 cours Olivier de Clisson.

Inscription

Les inscriptions au workshop sont gratuites et obligatoires. Elles sont indépendantes des inscriptions à la conférence principale JOBIM2019.

Les inscriptions sont désormais fermées.

Comité d’organisation

Florence Jornod
Xavier Bussel
Slim El Khiari
Julien Fumey
Victor Grentziger
Athénaïs Vaginay